אגף בכיר מוסדות תורניים מופקד על התמיכה בכ-1,850 מוסדות תורניים לתלמידים מעל גיל 18, המונים כ-175,000 תלמידים, בהתאם למבחני התמיכה. וכן, על מתן הסיוע הכלכלי למשפחות לומדי התורה, המוענק מתוך הכרה בתרומתם של האברכים לעולם לימוד התורה, לשימור העם היהודי, פיתוח תרבותו, ועתידו הרוחני בארץ ובעולם. כמו כן, מופקד האגף על תמיכה בתרבות חרדית. קיום פעילויות, שיעורים והרצאות בנושאים: תורבה שבכתב, תורה שבע"פ, הלכה, אגדה, מחשבת ישראל, מוסר, מנהגי ישראל, חגי ומועדי ישראל, הגות יהודית ותודעה יהודית וציונית.